Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col8a1Q00780 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col8a1Q00780 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms