Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms