Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
F8a1Q00558 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms