Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf7Q00417 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf7Q00417 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf7Q00417 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf7Q00417 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf7Q00417 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf7Q00417 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf7Q00417 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf7Q00417 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf7Q00417 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf7Q00417 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf7Q00417 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf7Q00417 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf7Q00417 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf7Q00417 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf7Q00417 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf7Q00417 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf7Q00417 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf7Q00417 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf7Q00417 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf7Q00417 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms