Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VldlrP98156 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VldlrP98156 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VldlrP98156 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VldlrP98156 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VldlrP98156 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VldlrP98156 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VldlrP98156 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VldlrP98156 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VldlrP98156 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VldlrP98156 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VldlrP98156 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VldlrP98156 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VldlrP98156 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VldlrP98156 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VldlrP98156 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms