Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms