Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfdP97946 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfdP97946 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfdP97946 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfdP97946 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfdP97946 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfdP97946 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfdP97946 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms