Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cry1P97784 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cry1P97784 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cry1P97784 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms