Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prop1P97458 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prop1P97458 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prop1P97458 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prop1P97458 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prop1P97458 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prop1P97458 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prop1P97458 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prop1P97458 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prop1P97458 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prop1P97458 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prop1P97458 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prop1P97458 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prop1P97458 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prop1P97458 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prop1P97458 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prop1P97458 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prop1P97458 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prop1P97458 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prop1P97458 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prop1P97458 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prop1P97458 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prop1P97458 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prop1P97458 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prop1P97458 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prop1P97458 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prop1P97458 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prop1P97458 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prop1P97458 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prop1P97458 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prop1P97458 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prop1P97458 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prop1P97458 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prop1P97458 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prop1P97458 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prop1P97458 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prop1P97458 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prop1P97458 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prop1P97458 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prop1P97458 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prop1P97458 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prop1P97458 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prop1P97458 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prop1P97458 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prop1P97458 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prop1P97458 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prop1P97458 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prop1P97458 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prop1P97458 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prop1P97458 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prop1P97458 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prop1P97458 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prop1P97458 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prop1P97458 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prop1P97458 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prop1P97458 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prop1P97458 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prop1P97458 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prop1P97458 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prop1P97458 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prop1P97458 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prop1P97458 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prop1P97458 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prop1P97458 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prop1P97458 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prop1P97458 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prop1P97458 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prop1P97458 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prop1P97458 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prop1P97458 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prop1P97458 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prop1P97458 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prop1P97458 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prop1P97458 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prop1P97458 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prop1P97458 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms