Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smyd1P97443 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms