Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps45P97390 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps45P97390 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps45P97390 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps45P97390 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms