Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms