Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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