Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms