Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad50P70388 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad50P70388 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad50P70388 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad50P70388 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad50P70388 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Rad50P70388 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad50P70388 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad50P70388 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms