Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx3P70354 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx3P70354 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx3P70354 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx3P70354 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx3P70354 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msx3P70354 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms