Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Cux2P70298 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cux2P70298 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cux2P70298 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Cux2P70298 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux2P70298 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux2P70298 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux2P70298 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms