Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plxna3P70208 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plxna3P70208 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms