Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tubb4bP68372 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms