Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbdP63072 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbdP63072 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbdP63072 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbdP63072 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbdP63072 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbdP63072 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbdP63072 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbdP63072 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbdP63072 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UbdP63072 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbdP63072 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbdP63072 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbdP63072 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbdP63072 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbdP63072 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbdP63072 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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UbdP63072 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbdP63072 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbdP63072 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UbdP63072 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbdP63072 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbdP63072 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbdP63072 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbdP63072 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbdP63072 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbdP63072 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbdP63072 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbdP63072 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UbdP63072 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbdP63072 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbdP63072 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbdP63072 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbdP63072 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbdP63072 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbdP63072 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbdP63072 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbdP63072 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbdP63072 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbdP63072 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbdP63072 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbdP63072 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbdP63072 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbdP63072 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbdP63072 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbdP63072 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbdP63072 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbdP63072 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbdP63072 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbdP63072 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbdP63072 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbdP63072 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbdP63072 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbdP63072 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbdP63072 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbdP63072 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbdP63072 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbdP63072 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbdP63072 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbdP63072 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbdP63072 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbdP63072 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbdP63072 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbdP63072 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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UbdP63072 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbdP63072 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbdP63072 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbdP63072 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UbdP63072 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbdP63072 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbdP63072 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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UbdP63072 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UbdP63072 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbdP63072 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbdP63072 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbdP63072 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbdP63072 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbdP63072 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbdP63072 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UbdP63072 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UbdP63072 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UbdP63072 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UbdP63072 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UbdP63072 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UbdP63072 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UbdP63072 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UbdP63072 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UbdP63072 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UbdP63072 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UbdP63072 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UbdP63072 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UbdP63072 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UbdP63072 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UbdP63072 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UbdP63072 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UbdP63072 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms