Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uba52P62984 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uba52P62984 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uba52P62984 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uba52P62984 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uba52P62984 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms