Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3P62908 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3P62908 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3P62908 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3P62908 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3P62908 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3P62908 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps3P62908 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps3P62908 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms