Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acta2P62737 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta2P62737 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acta2P62737 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms