Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan5P62080 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan5P62080 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms