Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmo4P61969 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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