Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms