Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms