Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf13P61216 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf13P61216 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms