Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2kP61087 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2kP61087 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ube2kP61087 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2kP61087 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2kP61087 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2kP61087 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2kP61087 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2kP61087 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2kP61087 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2kP61087 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2kP61087 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2kP61087 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2kP61087 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms