Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ActbP60710 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ActbP60710 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ActbP60710 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ActbP60710 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ActbP60710 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ActbP60710 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ActbP60710 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ActbP60710 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ActbP60710 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ActbP60710 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ActbP60710 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ActbP60710 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ActbP60710 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ActbP60710 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ActbP60710 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ActbP60710 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ActbP60710 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ActbP60710 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ActbP60710 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ActbP60710 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ActbP60710 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ActbP60710 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ActbP60710 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ActbP60710 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ActbP60710 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ActbP60710 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ActbP60710 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ActbP60710 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ActbP60710 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ActbP60710 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ActbP60710 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ActbP60710 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ActbP60710 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ActbP60710 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ActbP60710 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ActbP60710 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ActbP60710 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ActbP60710 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ActbP60710 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ActbP60710 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms