Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms