Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Csrnp3P59055 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Csrnp3P59055 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Csrnp3P59055 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Csrnp3P59055 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Csrnp3P59055 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Csrnp3P59055 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Csrnp3P59055 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Csrnp3P59055 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Csrnp3P59055 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Csrnp3P59055 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csrnp3P59055 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csrnp3P59055 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csrnp3P59055 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csrnp3P59055 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csrnp3P59055 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csrnp3P59055 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Csrnp3P59055 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms