Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P58686 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P58686 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P58686 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P58686 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P58686 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P58686 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P58686 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P58686 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P58686 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P58686 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P58686 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P58686 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P58686 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P58686 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P58686 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P58686 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P58686 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P58686 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P58686 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P58686 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P58686 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P58686 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P58686 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P58686 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P58686 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P58686 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P58686 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P58686 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P58686 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P58686 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P58686 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P58686 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P58686 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P58686 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P58686 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P58686 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P58686 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P58686 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P58686 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P58686 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P58686 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P58686 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P58686 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P58686 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P58686 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P58686 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P58686 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P58686 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P58686 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P58686 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P58686 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P58686 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P58686 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P58686 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms