Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpaP58389 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpaP58389 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpaP58389 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtpaP58389 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtpaP58389 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpaP58389 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpaP58389 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpaP58389 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpaP58389 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpaP58389 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpaP58389 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpaP58389 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpaP58389 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpaP58389 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpaP58389 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpaP58389 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpaP58389 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpaP58389 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpaP58389 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpaP58389 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpaP58389 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpaP58389 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms