Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms