Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CdaP56389 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CdaP56389 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CdaP56389 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CdaP56389 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CdaP56389 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CdaP56389 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CdaP56389 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CdaP56389 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CdaP56389 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CdaP56389 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CdaP56389 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CdaP56389 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CdaP56389 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CdaP56389 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CdaP56389 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CdaP56389 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CdaP56389 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CdaP56389 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CdaP56389 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CdaP56389 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CdaP56389 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CdaP56389 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CdaP56389 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CdaP56389 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CdaP56389 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CdaP56389 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CdaP56389 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CdaP56389 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CdaP56389 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CdaP56389 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CdaP56389 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CdaP56389 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CdaP56389 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CdaP56389 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CdaP56389 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CdaP56389 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CdaP56389 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CdaP56389 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CdaP56389 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CdaP56389 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CdaP56389 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CdaP56389 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CdaP56389 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CdaP56389 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CdaP56389 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CdaP56389 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CdaP56389 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CdaP56389 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CdaP56389 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CdaP56389 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CdaP56389 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CdaP56389 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CdaP56389 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CdaP56389 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CdaP56389 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CdaP56389 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CdaP56389 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CdaP56389 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CdaP56389 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CdaP56389 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CdaP56389 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CdaP56389 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CdaP56389 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CdaP56389 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CdaP56389 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CdaP56389 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CdaP56389 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CdaP56389 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CdaP56389 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CdaP56389 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CdaP56389 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CdaP56389 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CdaP56389 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CdaP56389 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CdaP56389 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CdaP56389 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CdaP56389 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CdaP56389 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CdaP56389 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms