Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GferP56213 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GferP56213 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GferP56213 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GferP56213 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GferP56213 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GferP56213 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GferP56213 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GferP56213 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GferP56213 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GferP56213 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GferP56213 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GferP56213 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GferP56213 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GferP56213 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
GferP56213 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GferP56213 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GferP56213 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GferP56213 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GferP56213 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GferP56213 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GferP56213 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GferP56213 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GferP56213 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GferP56213 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GferP56213 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GferP56213 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GferP56213 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GferP56213 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GferP56213 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GferP56213 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GferP56213 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GferP56213 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GferP56213 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GferP56213 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GferP56213 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms