Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms