Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GemP55041 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GemP55041 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GemP55041 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GemP55041 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GemP55041 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GemP55041 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GemP55041 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GemP55041 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GemP55041 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GemP55041 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GemP55041 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GemP55041 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GemP55041 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GemP55041 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GemP55041 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GemP55041 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GemP55041 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GemP55041 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GemP55041 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GemP55041 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GemP55041 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GemP55041 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GemP55041 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GemP55041 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GemP55041 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GemP55041 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GemP55041 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GemP55041 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GemP55041 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GemP55041 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GemP55041 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GemP55041 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GemP55041 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GemP55041 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GemP55041 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GemP55041 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GemP55041 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GemP55041 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GemP55041 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GemP55041 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GemP55041 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GemP55041 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GemP55041 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GemP55041 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GemP55041 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GemP55041 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GemP55041 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GemP55041 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GemP55041 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GemP55041 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GemP55041 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GemP55041 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GemP55041 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GemP55041 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GemP55041 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GemP55041 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GemP55041 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GemP55041 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GemP55041 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GemP55041 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GemP55041 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GemP55041 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GemP55041 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GemP55041 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GemP55041 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GemP55041 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GemP55041 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GemP55041 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GemP55041 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GemP55041 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GemP55041 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GemP55041 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GemP55041 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GemP55041 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GemP55041 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GemP55041 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GemP55041 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GemP55041 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GemP55041 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms