Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ApodP51910 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApodP51910 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ApodP51910 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApodP51910 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApodP51910 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApodP51910 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApodP51910 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ApodP51910 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ApodP51910 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApodP51910 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApodP51910 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ApodP51910 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ApodP51910 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ApodP51910 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApodP51910 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApodP51910 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ApodP51910 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ApodP51910 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ApodP51910 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApodP51910 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ApodP51910 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApodP51910 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApodP51910 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApodP51910 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApodP51910 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApodP51910 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApodP51910 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ApodP51910 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApodP51910 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApodP51910 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApodP51910 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApodP51910 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApodP51910 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApodP51910 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApodP51910 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApodP51910 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApodP51910 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApodP51910 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApodP51910 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApodP51910 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApodP51910 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApodP51910 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApodP51910 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApodP51910 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApodP51910 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ApodP51910 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApodP51910 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ApodP51910 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApodP51910 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApodP51910 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApodP51910 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ApodP51910 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApodP51910 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApodP51910 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApodP51910 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApodP51910 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApodP51910 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApodP51910 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApodP51910 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApodP51910 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApodP51910 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApodP51910 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApodP51910 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApodP51910 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApodP51910 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApodP51910 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApodP51910 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApodP51910 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApodP51910 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApodP51910 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApodP51910 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApodP51910 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApodP51910 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ApodP51910 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApodP51910 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms