Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx3P50481 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx3P50481 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx3P50481 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms