Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SftpdP50404 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SftpdP50404 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SftpdP50404 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SftpdP50404 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SftpdP50404 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SftpdP50404 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SftpdP50404 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SftpdP50404 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SftpdP50404 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SftpdP50404 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms