Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb42P49222 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb42P49222 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb42P49222 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb42P49222 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb42P49222 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb42P49222 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb42P49222 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb42P49222 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb42P49222 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb42P49222 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epb42P49222 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms