Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LmnaP48678 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LmnaP48678 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LmnaP48678 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LmnaP48678 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LmnaP48678 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LmnaP48678 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LmnaP48678 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LmnaP48678 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LmnaP48678 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LmnaP48678 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms