Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prox1P48437 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prox1P48437 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prox1P48437 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms