Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rfx1P48377 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms