Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms