Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VdrP48281 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VdrP48281 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VdrP48281 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VdrP48281 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VdrP48281 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VdrP48281 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VdrP48281 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VdrP48281 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VdrP48281 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VdrP48281 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VdrP48281 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VdrP48281 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VdrP48281 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VdrP48281 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VdrP48281 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VdrP48281 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VdrP48281 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VdrP48281 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VdrP48281 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VdrP48281 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VdrP48281 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VdrP48281 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VdrP48281 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VdrP48281 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VdrP48281 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VdrP48281 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VdrP48281 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VdrP48281 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VdrP48281 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VdrP48281 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VdrP48281 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VdrP48281 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VdrP48281 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VdrP48281 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VdrP48281 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VdrP48281 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VdrP48281 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VdrP48281 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VdrP48281 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VdrP48281 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VdrP48281 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VdrP48281 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VdrP48281 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VdrP48281 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VdrP48281 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VdrP48281 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VdrP48281 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VdrP48281 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VdrP48281 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VdrP48281 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VdrP48281 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VdrP48281 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VdrP48281 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VdrP48281 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VdrP48281 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VdrP48281 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VdrP48281 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VdrP48281 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VdrP48281 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VdrP48281 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VdrP48281 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VdrP48281 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VdrP48281 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VdrP48281 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VdrP48281 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VdrP48281 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VdrP48281 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VdrP48281 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VdrP48281 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VdrP48281 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VdrP48281 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VdrP48281 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VdrP48281 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VdrP48281 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VdrP48281 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VdrP48281 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VdrP48281 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VdrP48281 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VdrP48281 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VdrP48281 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VdrP48281 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VdrP48281 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VdrP48281 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VdrP48281 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VdrP48281 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VdrP48281 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VdrP48281 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VdrP48281 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VdrP48281 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VdrP48281 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VdrP48281 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VdrP48281 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VdrP48281 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VdrP48281 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VdrP48281 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VdrP48281 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VdrP48281 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VdrP48281 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VdrP48281 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms