Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SrprbP47758 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrprbP47758 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrprbP47758 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrprbP47758 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrprbP47758 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrprbP47758 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms