Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd4P46935 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms